In der Endrunde um die Deutsche Meisterschaft 1928/29 spielte der HSV in der Vorrunde gegen den Meidericher SV in Duisburg und gewann durch Tore von Kolzen, Harder und Horn mit 3-2.
Das Spiel der Zwischenrunde gegen die Spvgg Fürth fand im Altonaer Stadion statt. Der HSV verlor mit 0-2. Der Traum von der Titelverteidigung war geplatzt, obwohl bis auf eine Ausnahme die Meistermannschaft von 1928 spielte.
Endrunde um die Deutsche Meisterschaft
Vorrunde:
HAMBURGER SV – Meidericher SV 3-2
Zwischenrunde:
HAMBURGER SV – Spvgg. Fürth 0-2
Norddeutsche Meisterschaft
| Verein | Tore | Punkte | Spiel | |
| 1. | HAMBURGER SV | 7-5 | 4-2 | aus HSV Sicht |
| 2. | Holstein Kiel | 7-4 | 4-2 | 3-1 |
| 3. | Hannover 96 | 7-3 | 4-2 | 1-3 |
| 4. | Altona 93 | 1-10 | 0-6 | 3-1 |
Infolge von Punktgleichheit der ersten Drei gibt es Entscheidungsspiele dieser Vereine. Der HSV gewinnt gegen Holstein Kiel 4-2 und Holstein schlägt Hannover 96 mit 4-1. Damit sind der HSV und Holstein Kiel für die Deutsche Meisterschaft qualifiziert.
Die Vorrunde zur Norddeutschen Meisterschaft gewinnt der HSV gegen Olympia Neumünster mit 4-2. In der Zwischenrunde wird Union Altona 3-1 geschlagen.
Hamburger Meisterschaft
Der HSV und weitere Hamburger Vereine widersetzen sich der Satzung des NFV und des DFB. Daher wird keine Meisterschaft ausgespielt.