In der 46. Bundesliga-Saison 2008/09 spielte der HSV lange in der Spitzengruppe der Liga um den Titel mit und beendete die Saison auf dem 5. Tabellenplatz. Damit gelang erneut die Qualifikation für den internationalen Wettbewerb.
In der UEFA-Cup Saison 2007/08 scheiterte der HSV im Achtelfinal an Ligakonkurrent Bayer Leverkusen. Der 3-2 Heimsieg im Rückspiel reichte aufgrund 0-1 Hinspielniederlage nicht zum Weiterkommen.