Beim HSV wurde zur dritten Zweitligasaison Trainer Daniel Thioune verpflichtet, mit dem der Aufstieg in die Bundesliga gelingen sollte. Die Mannschaft startete mit 5 Siegen in die Saison und setzte sich gleich an der Tabellenspitze fest. Als Spitzenreiter ging es auch in die zweite Saisonhälfte, in der nicht mehr viel zusammenlief.
Die gute Ausgangslage wurde insbesondere durch Niederlagen gegen die Abstiegskandidaten verspielt und Trainer Thioune drei Spieltage vor Saisonende entlassen. Auch mit Interimscoach Horst Hrubesch gelang es nicht mehr unter die erste Drei zu kommen und der HSV schloss die Saison erneut auf Platz 4 ab.
Die Corona-Pandemie sorgte dafür, dass ein Großteil der Spiele ohne Zuschauer stattfinden musste.
| Pl. | Mannschaft | Sp. | S | U | N | Tore | Diff. | Pkt. |
| 1 | VfL Bochum | 34 | 21 | 4 | 9 | 66:39 | 27 | 67 |
| 2 | SpVgg Greuther Fürth | 34 | 18 | 10 | 6 | 69:44 | 25 | 64 |
| 3 | Holstein Kiel | 34 | 18 | 8 | 8 | 57:35 | 22 | 62 |
| 4 | Hamburger SV | 34 | 16 | 10 | 8 | 71:44 | 27 | 58 |
| 5 | Fortuna Düsseldorf | 34 | 16 | 8 | 10 | 55:46 | 9 | 56 |
| 6 | Karlsruher SC | 34 | 14 | 10 | 10 | 51:44 | 7 | 52 |
| 7 | SV Darmstadt 98 | 34 | 15 | 6 | 13 | 63:55 | 8 | 51 |
| 8 | 1. FC Heidenheim | 34 | 15 | 6 | 13 | 49:49 | 0 | 51 |
| 9 | SC Paderborn 07 | 34 | 12 | 11 | 11 | 53:45 | 8 | 47 |
| 10 | FC St. Pauli | 34 | 13 | 8 | 13 | 51:56 | -5 | 47 |
| 11 | 1. FC Nürnberg | 34 | 11 | 11 | 12 | 46:51 | -5 | 44 |
| 12 | Erzgebirge Aue | 34 | 12 | 8 | 14 | 44:53 | -9 | 44 |
| 13 | Hannover 96 | 34 | 12 | 6 | 16 | 53:51 | 2 | 42 |
| 14 | Jahn Regensburg | 34 | 9 | 11 | 14 | 37:50 | -13 | 38 |
| 15 | SV Sandhausen | 34 | 10 | 4 | 20 | 41:60 | -19 | 34 |
| 16 | VfL Osnabrück | 34 | 9 | 6 | 19 | 35:58 | -23 | 33 |
| 17 | Eintracht Braunschweig | 34 | 7 | 10 | 17 | 30:59 | -29 | 31 |
| 18 | Würzburger Kickers | 34 | 6 | 7 | 21 | 37:69 | -32 | 25 |
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