Die 48. Bundesliga-Saison 2010/11 verlief erneut enttäuschend für den HSV. Der neue Trainer Armin Veh wurde im Laufe der Rückrunde entlassen und durch Co-Trainer Michael Oenning ersetzt. Am Ende sprang der 8. Tabellenplatz heraus.
Der HSV beendete die 41. Bundesliga-Saison 2003/04 auf dem 8. Tabellenplatz. Trainer Kurt Jara wurde im Herbst 2003 entlassen und durch Klaus Toppmöller ersetzt.
Die 38. Bundesliga-Saison 2000/01 beendete der HSV auf dem enttäuschenden 13. Tabellenplatz. Die Doppelbelastung durch die teilweise berauschenden Auftritte in der Champions League konnte die Mannschaft in der Liga nicht kompensieren.
Die 39. Bundesliga-Saison 2001/02 begann mit einem Fehlstart, dem Trainer Frank Pagelsdorf zum Opfer fiel. Interimscoach Holger Hieronymus übergab nach zwei sieglosen Spielen an Kurt Jara, unter dem am Ende der 11. Tabellenplatz erreicht wurde.
In der Saison 2000/01 nahm der HSV das erste Mal an der Champions League Gruppenphase teil. Legendär wurde dabei das erste Spiel im heimischen Volksparkstadion gegen Juventus Turin (4:4).
Die 37. Bundesliga-Saison 1999/2000 war für den HSV die beste Saison seit den erfolgreichen 80er Jahren. Am Saisonende belegte das Team von Frank Pagelsdorf den 3. Tabellenplatz und schaffte die Qualifikation zur Champions League.
Die 34. Bundesliga-Saison 1996/97 verlief enttäuschend. Die Erwartungen nach dem Aufschwung unter Trainer Felix Magath waren hoch. Allerdings wurde Magath zwei Spieltage vor Saisonende in Abstiegsnot entlassen.