Die 25. Bundesliga-Saison 1987/88 begann mit dem großen Umbruch. Nach dem DFB-Pokalsieg verließ Erfolgs-Trainer Ernst Happel den Verein. Sein Nachfolger wurde der Jugoslawe Josip Skoblar, der noch in der Hinrunde seinen Platz räumen musste. Es übernahm Willi Reimann. Am Ende erreichte der HSV den 6. Tabellenplatz.
Im Supercup vor Saisonbeginn wurde Torwart Uli Stein in der 88. Minute vom Platz gestellt, nachdem er Bayern Stürmer Wegmann einen Faustschlag versetzte. Stein wurde anschließend beim HSV aussortiert. Sein Nachfolger wurde Torwart Mladen Pralija aus Jugoslawien. Daraufhin verlor der HSV bei den Bayern in der Bundesliga mit 0-6.
Tabelle:
| Verein | Tore | Diff. | Punkte | Heimspiel | Auswärtsspiel | |
| 1. | Werder Bremen | 61-22 | +39 | 52-16 | 0-0 | 4-1 |
| 2. | Bayern München | 83-45 | +38 | 48-20 | 2-2 | 0-6 |
| 3. | 1.FC Köln | 57-28 | +29 | 48-20 | 3-0 | 0-1 |
| 4. | VfB Stuttgart | 69-49 | +20 | 40-28 | 3-0 | 1-5 |
| 5. | 1.FC Nürnberg | 44-40 | +4 | 37-31 | 2-2 | 2-2 |
| 6. | Hamburger SV | 63-68 | -5 | 37-31 | Aus HSV-Sicht | |
| 7. | Mönchengladbach | 55-53 | +2 | 33-35 | 2-1 | 2-8 |
| 8. | Bayer Leverkusen | 53-60 | -7 | 32-36 | 3-2 | 0-2 |
| 9. | Eintracht Frankfurt | 51-50 | +1 | 31-37 | 2-2 | 0-3 |
| 10. | Hannover 96 | 59-60 | -1 | 31-37 | 3-3 | 1-3 |
| 11. | Bayer Uerdingen | 59-61 | -2 | 31-37 | 3-1 | 1-1 |
| 12. | VfL Bochum | 47-51 | -4 | 30-38 | 2-2 | 0-4 |
| 13. | Borussia Dortmund | 51-54 | -3 | 29-39 | 4-3 | 3-2 |
| 14. | Kaiserslautern | 53-62 | -9 | 29-39 | 5-1 | 3-0 |
| 15. | Karlsruher SC | 37-55 | -18 | 29-39 | 0-4 | 0-0 |
| 16. | SVW Mannheim | 35-50 | -15 | 28-40 | 1-1 | 2-2 |
| 17. | Fc Homburg | 37-70 | -33 | 24-44 | 2-1 | 2-0 |
| 18. | FC Schalke 04 | 48-84 | -36 | 23-45 | 5-2 | 0-1 |
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